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    Alcance y forma del curso:
    El alcance del curso es dar a los estudiantes una introducción detallada a la bioinformática y los algoritmos de la bioinformática utilizados para la construcción de los métodos de predicción de alta calidad. Se hará hincapié en la aplicación de los algoritmos en términos de programas computacionales. El curso consta de conferencias, discusiones, ejercicios y proyecto.
    Duración y lugar del Curso:
    2 semanas, del lunes 28/2 al viernes 11/3, de 10 a 17 con una hora de almuerzo. Lugar: Departamento de Computación, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires
    Objetivos generales:
    Proporcionar al alumno una visión general y comprensión profunda de algoritmos de bioinformática. Permitir al estudiante primero evaluar cual algoritmo será el más adecuado para responder a una pregunta biológica determinada y segundo implementar y desarrollar herramientas de predicción basadas en este tipo de algoritmo para describir complejos problemas biológicos.
    Contenido:
    El curso cubrirá los algoritmos más utilizados en la bioinformática. Los siguientes temas serán cubiertos:
    • Programación dinámica (Dynamic programming): Needleman-Wunsch, Smith-Waterman, and alignment heuristics
    • La redundancia de datos y la reducción de la homología (Data redundancy and homology reduction): Hobohm and other clustering algorithms
    • Matrices Peso (Weight matrices): Sequence weighting, pseudo count correction for low counts, Gibbs sampling, and Psi-Blast
    • Modelos ocultos de Harkov (Hidden Markov Models): Model construction, Viterbi decoding, posterior decoding, and Baum Welsh HMM learning
    • Las redes neuronales artificiales (Artificial neural networks): Architectures and sequence encoding, feed-forward algorithm, back propagation and network training
    Correlativas:
    Probabilidad y Estadística
    Algoritmos y Estructuras de Datos II

     

    Alumnos de otras disciplinas/otras facultades:

    Les proponemos que realicen la preinscripción y averigüen en el Depto. de Alumnos de la FCEyN (Pabellón II, Ciudad Universitaria), las condiciones para cursar.
     
     
    Responsables:
    Prof. Morten Nielsen, Profesor Asociado en Center for Biological Sequence
    Analysis,  Department of Systems Biology,  The Technical University of
    Denmark.  E-mail:mniel@cbs.dtu.dk.
    Prof. Verónica Becher, vbecher@dc.uba.ar

    Pagina del curso con mas información:
    http://www.cbs.dtu.dk/courses/BAcourse